台灣本土貝類數位典藏計畫在第一、二期已分別建立台灣貝類名錄、台灣貝類標本、貝類文獻、世界貝庫、貝塚貝類、貝類化石、散佚海外的台灣貝類等主要資料庫及其他相關資料庫。為求台灣貝類資料庫的永續經營及完整呈現台灣貝類的研究成果，在未來2年的永續經營規劃上，我們將進行如下的工作：

1. 台灣貝類古文獻的蒐集與數位化：大多數台灣貝類原始學名發表的文獻，至今皆已超過五十年以上，其著作權已成為全民共享，應可提供公開數位化且可搜尋內文之檔案，供所有人瀏覽與下載，為了方便學術利用及參考，我們將進行貝類古文獻的蒐集整理及數位化。
2. 貝類顯微構造的數位化：分別為貝類的齒舌與貝殼微細構造。貝類的齒舌是軟體動物門的重要的分類特徵，同時也與貝類的食性與棲息生態環境有很密切的關係。貝殼是大部分貝類不可或缺的構造，由外而內，貝殼通常分為三層，殼皮、稜柱層與真珠層。建立完整的貝類顯微構造資料庫，可提供學術研究。
3. 世界貝庫的擴充：以已出版的貝類專書為基礎，繼續擴建原有的世界貝庫，並以尚未進行的非洲、歐洲及中南美洲為未來兩年的重心。
4. 綠島迷你貝標本的研究與數位化：綠島迷你貝標本約有1,400種，這些尚未包含在目前台灣貝類資料庫網站中，其中包括100種以上的新種或紀錄種，迷你貝的研究成果將會出版專書。

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